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以人在測量飽和血氧濃度時通常夾是指尖或是耳垂上。動物在麻醉過程中，最普遍將感應器夾在舌頭，但舌頭在濕滑或動物躁動的狀況下，感應器容易滑落。其他可以測定的部位為動物的耳朵（需除毛）、腳掌（需透光度佳）（圖1）、陰部、包皮、後腳外轉肌與長腓骨肌肌腱間易透光處（圖2），但需考慮動物毛色、膚色深度及誤差值。
當血氧飽和度較高時，血氧飽和度有良好的準確度。但是在飽和度偏低時，測定的誤差就會相對增加。一般來說，血氧飽合度在70%以上時，大概有2%左右的誤差；介於50~70%時，大概有3%左右的誤差；在50%以下時，不能夠保證所測數值的準確度。
另一個影響準確度的因素是機器的反應時間。結果的顯示會有短暫的延遲，一般而言手指的偵測器會有24~35秒的延遲，耳垂的會有10~20秒。延遲的原因是機器要對訊號進行運算的結果。因此，延遲的時間與主機的效能及感應器的靈敏度有相當大的關係。靈敏度高的監測器，抗躁動能力強，脈搏波形會隨躁動狀況即時顯現，血氧數值變化的搜尋時間也會明顯較短。
在解釋血氧濃度的測定結果時，需要考慮到脈氧計的限制，以免造成不正確的認定。最重要的一點是，血氧飽和度和血氧濃度是不同的，不能混為一談。氧氣與血紅素的解離曲線是S形的曲線，血氧濃度的變化發生在曲線兩端時，卻有可能只有很小的飽合度變化。於是病畜的血氧濃度大幅下降時，血氧飽合度卻只有少量的改變。另一方面，也有可能血氧濃度上升到可能造成傷害的程度時，血氧飽和度卻沒有明顯的改變。另一個重點是，脈氧計並沒有提供有關血中酸鹼值及二氧化碳濃度的資訊。於是病畜如果有二氧化碳濃度升高，造成嚴重的酸血症，脈氧計並不能偵測出來。所以醫療人員不能只用脈氧計來做為呼吸狀態的監測工具。(相關資訊請參考宇麥動物醫療專刊2006秋季號-狗貓的動脈血液氣體分析)
血液的灌流量不足時會影響到血氧飽和度的測定，比如說心輸出較低、血管收縮、以及低溫時，偵測器會感應不到動脈的搏動狀態。
在手術過程中，醫師可以藉由脈氧計來判斷動物是否缺氧，尤其是在緊急的情況時。進行多項檢查時，若缺乏動脈血液氣體分析（Blood Gas）儀器的輔助，脈氧計也可以提供初步的手術前評估的輔助。分娩的過程中，脈氧計可以監測母畜及初生動物的血氧飽和度。在動物呈現瀰留狀態時亦可應用於監控生理狀態，以提早預警方便緊急救治或通知病畜飼主。
二氧化碳計（Capnography）監測潮氣末二氧化碳（etCO2）
紅外線吸收光譜以及質譜儀是較常用來測定二氧化碳濃度的方式。二氧化碳的吸收光譜，在波長4280微米處有很強的吸收。紅外線通過 要被測定的氣體後，一部份被二氧化碳吸收，剩下的射進偵測器裡，再轉換成電子訊號。二氧化碳的濃度越高，被吸收的光就越多，而射進偵測器的光就越少。這個方法可以即時而連續的偵測二氧化碳濃度，結果的呈現約有0.25秒的信號延遲。質譜儀也可以測定二氧化碳，而且測定結果十分準確，信號的延遲也只有0.1秒，但是價格十分昂貴，無法隨身攜帶。
etCO2監測已被美國麻醉醫師協會（ASA）列為術中常規監測項目之一，etCO2監測儀可分為主流型（main stream)（圖3）和側流型（side stream)（圖4）兩種。
主流型分析就放置在呼吸的通路上，經常是在氣管內管的末端與Y型管的中間。因為測定是在呼吸的管路上進行，延遲的時間可以縮到最小，也不會增加呼吸所需要的功，管路不會被痰堵住，適合呼氣潮氣體積不大的小動物。但缺點是分析器的重量較重，有可能造成管路的折彎或是氣管內管的脫落，但現有最新的偵測器已經改善許多。
另一種是側流型分析，呼出氣體經由呼吸通路上的側向管線被吸到分析儀器裡。以吸收光譜或質譜儀來測定。這種方法只會增加一點點重量在管路上，但是側管有可能會被痰給堵住，延遲的時間也會比較久，並且連續測定會使得呼氣的潮氣體積稍稍減少。對於5公斤以下小動物，容易影響其準確率。
二氧化碳的濃度圖形可分成三個階段：第一階段是代表從解剖上的無用空間(Dead Space)所排出的氣體，好比說氣管裡的氣體，裡面沒有二氧化碳。第二階段是代表從肺泡裡和無用空間裡排出的混合氣體，
其中的二氧化碳濃度驟然上升。呼氣時會排出越來越多肺泡裡的氣體，二氧化碳的濃度一直上升到高原期，也就是第三階段，代表的是全都是從肺泡裡排出的氣體。在吸氣的時候，二氧化碳的濃度會急速的下降到零。在吸氣期之前，高原期結束的那個點所測得的值稱為PetCO2 (End tidal CO2 concentration 潮氣末二氧化碳分壓)。二氧化碳計的圖形改變也可以清楚的呈現臨床的情況，波形突然消失，可能代表呼吸停
止、自動呼吸器工作故障、呼吸迴路管道脫落或氣道梗阻。另一方面，波形逐漸消失，可能意味著肺栓塞或迴圈驟停導致肺血流的突然減少或中止。etCO2基線突然抬高可能表示CO2吸收劑的耗竭、呼吸活瓣失靈、校正錯誤或紅外線探測室水蒸氣過多等原因。平臺改變可能表示呼出氣流受阻（平臺坡度增大）或由於神經肌肉鬆弛藥作用的消退出現膈肌運動（平臺出現切跡）。總之，etCO2是生理的反應非常靈敏而且反應多面向的黃金指標，同時可提供病畜通氣狀態及麻醉裝置完整性的資訊。
etCO2通常是最迅速反應動物在麻醉狀況下通氣狀況、呼吸及代謝功能、氧合與心肺功能的生理參數，對緊急狀況的處理，有早期預警的優勢。
在二氧化碳計的圖形保持穩定，溫度恆定且心肺功能穩定時，etCO2可以用來估計PaCO2。此外二氧化碳計可以用來確保充足的肺部通氣，偵測肺部血流及無用空間的改變等。
etCO2反應的數值與圖形，可確認氣管內管的位置正確，插管是插進氣管，而不是插進食道，並且幫助醫護人員提早發現呼吸管路的脫落或是阻塞。並可協助監測肺泡的通氣狀態，監測心肺復甦術的進行。當心輸出量和肺部血流量突然減少時，生理的無用空間會增加，etCO2的值也會下降，使得P(a-et) CO2會增加，因此可以用來幫助診斷肺栓塞。
麻醉過程中，依照監控的目的和重要性，可以分為：
血氧飽和度（SpO2）與潮氣末二氧化碳（etCO2）。此兩項生理數值所代表的意義為動物體內血液含氧量的重要指標，因為體內含氧量 過低時會直接造成腦部缺氧，使動物休克甚至死亡。對動物的傷害是即時性的，因此列為主要安全指標。
SpO2與etCO2之間雖沒有直接的關係，但是其變化趨勢和反應時間不同，也代表不同的臨床狀況。（請參閱附表）
這類指標如心跳（HR）、血壓（BP）、心電圖（ECG）等，這些生理數值並非不重要，而是當這些數值過高或過低時，並不會馬上危及動物生命，但也需謹慎處理，儘快將數值調整回安全範圍。
為其他標準麻醉訊號，其價值是輔助麻醉過程中有很好的麻醉品質。
手術過程中持續監控動物的生理參數是必要的安全措施，在輔助儀器的協助下，精確、穩定、靈敏度高的生理監測器是基本的要求，才不會造成監控過程中反而干擾手術進行的窘境。測定SpO2時，靈敏度是重要指標，可測定儀器是否在短時間內即可搜尋獲得病畜血氧飽和度的數值，這與感應器和主機的效能有關。評估採用主流型或側流型的etCO2測定儀器時，通常主流型的模組搭配完整的生理監視器，擴充能力強，但成本通常也會比側流式的單機高。心電圖（ECG）與呼吸次數（RESP）的波形變化可以評估生理監視器的穩定度和靈敏度，靈敏度高的ECG和RESP測定，在波形上會即時的反應病畜的心電圖和呼吸的強弱、頻率，甚至擁有精確警報ASY、PVC/min、ARR、VF、VT、BRDY等功能。在選擇適合的監控系統若能掌握以上幾個要素，並考慮醫院真正的需求與成本，才能真正達到監控手術過程順利，萬無一失的目的。
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